扣除标准对内资企业来说是一个很重要的问题。之前征求意见时，讨论的焦点集中在保险、定额工资以及各种经费的扣除比例上。新税法规定，内外资企业是统一的，都是据实扣除合理的工资支出，而现行税法里面外资企业都是全额扣除的。按新税法的规定，可以理解为只要企业能够支付，内资企业员工的工资为 100% 扣除。下一步国家税务总局和财政部会联合发文，做一些特别的限定，比如针对高管的工资不能滥发，将规定一个比例，至于比例是多少，还有待讨论。另外，新税法不会针对某个特定的行业进行相关工资扣除限制，这样不符合公平的原则。

  其他扣除项目和标准包括：广告和宣传费限定为不超过当年营业收入或者销售收入的 15%，以前是分为两个档次，而且分为不同的行业，这次就取消了这种划分，但是这次没有扣除的可以无限结转，当年没有扣除的份额可以往后结转。企业购买安全、环保设备的设备投资额的 10% 可以扣除，当年扣除不了的话可以往后结转五年。